El intelectual es una de las figuras más admiradas por el presidente venezolano. En una carta declaró su "total solidaridad" con la magistrada detenida por excarcelar a un opositor

María Lourdes Afiuni desató la ira del gobierno de Chávez cuando liberó condicionalmente al banquero Eligio Cedeño, quien estaba acusado de corrupción. Según la organización Human Rights Watch, el Grupo de Trabajo de la ONU sobre la Detención Arbitraria declaró arbitraria la detención de Cedeño.

Las autoridades venezolanas aprehendieron a Afiuni después de la liberación de Cedeño y la acusaron de abuso de autoridad, corrupción y de "favorecer la evasión de la justicia", dijo Human Rights Watch. Chávez la tacho de "bandida" y dijo que debía ser sentenciada a 30 años de cárcel, de acuerdo con ese grupo. Estuvo en una prisión para mujeres, donde fue insultada y amenazada con frecuencia. Para Chomsky, la jueza recibir un "trato denigrante".

Tras enviarle una carta pública al mandatario el fin de semana, Chomsky, profesor de lingüística en el Instituto Tecnológico de Masachusets, comentó que su comunicación privada con el gobierno de Chávez pudo haber contribuido a convencerlo de concederle el arresto domiciliario a Afiuni.

"Considero que era apropiado intentar y hacer una declaración pública con la esperanza y la expectativa de que pudiera llevar a un gesto humanitario para liberarla", dijo Chomsky. "Creí que había algo más que debía hacerse".

Human Rights Watch determinó que el gobierno venezolano "minó sistemáticamente la libertad periodística de expresión" y la independencia del establecimiento judicial del país. El intelectual, reconocido también por varios sectores de la izquierda latinoamericana, dijo: "No creo que sea aislado", dijo Chomsky en referencia al asunto de Afiuni. "Pero no estoy convencido de que haya una tendencia mayor" de represión en Venezuela. "No puedo pensar en un país donde no haya represión ilegal, ni siquiera en Estados Unidos", agregó.

Chávez ha calificado a Chomsky como una inspiración, e incluso hizo una famosa recomendación de sus libros en el 2006 durante un discurso ante la Asamblea General de las Naciones Unidas. El intelectual afirmó que se habían reunido con y tenido una conversación de "un par de horas", como lo hacía con otros jefes de Estado.